一种基于阀泵的单细胞捕获平台
由于个体细胞的动态行为和异质性信息,仅测定细胞群平均值会掩盖单细胞中蕴含的遗传信息。传统采用移液枪分离和处理单细胞的方法费时费力且易出错。
如视频1所示,基于阀泵技术,Fluidigm建立的C1?单细胞全自动制备系统可快速可靠地分离单个细胞并进行基因组分析。该系统为研究个体细胞间异质性,分析个体细胞对特定刺激的反应,验证重要疾病生物标志物,检测RNA干扰沉默基因表达和候选药物筛选等开启了新的大门。
视频1C1?单细胞全自动制备系统简介
C1?单细胞全自动制备系统内部结构如图1所示,该系统具有以下特点:
1.一体化:完整的自动化流程一步操作实现单细胞捕获、制备到核酸样本提取
2.准确性:可准确测量单个细胞间基因表达谱差异
3.灵活性:可扩展至全转录组
4.简便易用:以优化的流水线工作流程和直观的界面简化细胞分离和制备过程
5.快速性:一天内可完成从细胞加入到数据收集
图1FluidigmC1?全自动系统
C1?仪器外观展示如下视频2所示。
视频2C1?仪器外观展示
C1?微流体芯片及单细胞捕获结构如图2所示,该结构可在不到一小时的手工操作时间重复性地制备96个单细胞。使用这一完整的流程,研究者可以捕获和确认单细胞,裂解细胞,反转录,预扩增目标和回收产物用于定量PCR或测序文库的制备。
图2C1?微流体芯片及单细胞捕获结构
C1?微流体芯片其它结构如图3所示。
图3
C1?单细胞捕获视频如3所示。
视频3C1?单细胞捕获结构流程
参考文献
[1]Low-coveragesingle-cellmRNAsequencingrevealscellularheterogeneityandactivatedsignalingpathwaysindevelopingcerebralcortex..
[2]
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