文献数据库不太友好PubMed了解一下
作者说:
众所周知
文献在研究生的学术生活所扮演的角色
举重若轻
但仍难免不会吐槽下
文献数据库不太友好的浏览界面
以及获取全文权限的障碍无处不在
为此
笔者结合个人的小小经验
就文献的浏览和下载部分跟各位写下自己的一些做法和心得
希望可以给各位带来一些具备参考意义的东西
PubMed的浏览优化及文献全文的简易获取
说起PubMed,相信生物医药领域的同学,必定不陌生这个NCBI旗下的学术权威性极高的文献数据库。
然而,它的文献浏览界面的体验却难以让人对文献产生一种求知若渴的感觉。
不难看出,它的初始界面让良好的体验感羞涩起来的原因主要有:
对搜索结果的过滤条件难以满足或不符合研究者自身的需求;
期刊信息不全或没突出我们所需要的IF,JCR分区;
不能直接获取文献全文。
可见,初始界面给人的距离感确实是蛮大的。
但是呢,PubMed也并非出于给研究者设个坑的目的,才让初始界面如此的不友善,相反,专注于文献的收集、归类、整理的Pubmed,就像是一块极好的石料,给足了每位研究者个性化的空间,那么,如何将这块极好的石料结合自身的需求来发挥最大的价值,决定权也许还是在于我们自己。
不妨先看下笔者的PubMed界面。
如果有被该gif吸引到的读者
那么,请往笔者下面如往实现以上gif,主要分为以下几部分:
Part.1
工具的准备
鉴于篇幅有限,因此,此文重点放在笔者的整个实现流程,而不在工具等其他的介绍,有兴趣的东西可以自行查阅相关资料,或者有机会的话,后面再展开。
(注:以下工具,笔者可提供,但若是可以科学上网的读者,建议在chrome的webstore自行下载安装)
1.安装GoogleChrome浏览器:浏览PubMed的浏览器
这个安装流程,笔者就不展开,各位依据各自爱好安装就好。
2.安装Scholarscope插件:用于PubMed浏览界面的期刊IF、JCR分区的显示
流程如下:将crx文件拖到Extension界面,安装就好,最后还需要一些操作(文章最后部分会谈到)
3.安装Tampermonkey插件:脚本安装管理器,用于后续安装Sci-Hub脚本
该插件的安装也跟以上一样,将其crx文件拖到Extension界面,安装就好。
但这个插件的不同之处在于,它只是个脚本安装器,自身并不带上任何脚本。为此,我们需要把SCI-Hub脚本找到,并把它给它安装上。
在这里,简单说下,脚本这个存在。举个例子,我们平时上的百度这些网站,直接加载出来的是百度那边提供给我们看到的界面,但脚本可以把百度给出来的界面来个进一步的加工,变成我们想要脚本变成的界面,如SCI-Hub脚本。
Part.2
下载
同时,SCI-Hub脚本在绝大部分文献网站均可以使用。在这里,对开发SCI-Hub脚本的开发者致以最大的敬意,感谢!
Part.3
PubMed文献的精准搜索
当然,相信以上的几个工具,可以给PubMed的原有浏览和文献下载体验提升不够。但是呢,结合我们的需要而言,似乎还欠缺了一个那就是如何快速地、精准地找到高质量的文献的体验升级,好比搜索结果都显示期刊的信息和文献全文下载方式,但是,如何将高质量的文献集中在一块,那是当前优化的PubMed界面还做不到的。
笔者想,高质量的最新的文献,对于我们的研究进展的重要性不言而喻。因此,最后部分,为各位带来一个PubMed的精准搜索的小技巧。
首先,先注册一个NCBI的账号,注册流程比较简单,点击PubMed右上角的Signin后进行注册的操作,这里就不展开了。
但是,得强调下NCBI账号的重要性:1.它是设置精准筛选的个性化过滤条件的前提;2.一账号,一PubMed,设置好的个性化过滤条件会跟账号一同出现,即是说,无论是在哪台电脑登录PubMed,这些个性化过滤条件都可以使用。
接下来,设置个性化过滤条件:在搜索结果的PubMed页面,先登录NCBI账号,后点击右边“ManageFilters”,后点击scholarscope插件,选择“在线工具库”,PubMedFilter生成器会依据你的需要生成让PubMed可以识别的条件语言,然后就是下面GIF操作就可以了。
另外,注意下,设置好,需点击过滤条件的激活。
最后,相信你的PubMed界面也会如下图:
所以,期待各位可以在PubMed上的体验会因此而得到些许改善。
Part.4
注意点
需要注意的是,如果是可以科学上网的读者,建议直接在Chrome的webstore下载安装,无需执行以下的操作;若是坚守大陆的读者,安装后,还需要进一步的操作,以免重启Chrome时,出现插件无法使用。(该部分参考
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